Illumina
美国Illumina公司自2006年进军基因测序市场以来,陆续发布了HiSeq、MiSeq、NextSeq等一系列测序仪器。
(Illumina公司的各型号测序仪)
测序方法采用边合成边测序的方法,基于专有的可逆终止化学反应原理。测序时将基因组DNA的随机片段附着到光学透明的玻璃表面(即Flow cell),这些核酸片段经过延伸和桥式扩增后,在Flow cell上形成了数以亿计Cluster,每个Cluster是具有数千份相同模板的单分子簇。然后利用带荧光基团的四种特殊脱氧核糖核苷酸,通过可逆性终止的SBS(边合成边测序)技术对待测的模板DNA进行测序。
(Illumina测序原理)
illumina 平台众多,各有侧重,适合不同样本测序,下面介绍illumina主流测序仪器的区别,大家可根据实际需求选择合适的测序平台!
不同仪器应用如下:
第二代测序技术的核心思想是边合成边测序(Sequencing By Synthesis),即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列,其中Illumina公司处于一个垄断地位,下面就illumina产品进行介绍:
详细介绍如下:
MiniSeq系统:门槛最低、最易于实现的测序解决方案。即使是少量的样本,它也能够实现经济高效的测序。
单次数据产出范围在1.65-7.5Gb
Reads数:7-25 million
应用:靶向基因、小基因组、扩增子测序、16S宏基因组学等。
MiSeq 系统:适用于快速、省成本的二代测序可以在单次运行中读取
2X300bp的长度。
单次数据产出范围在540Mb-15Gb
Reads数:1-25 million(v2达到15 million,v3达到 25million)
应用:靶向基因、小基因组、扩增子测序、16S宏基因组学等。
NextSeq 550系统:快速、灵活、高通量的台式测序仪,在Illumina测序技术准确性的基础上,实现转录组和靶向重测序应用。
可以在单次运行中读取2X150bp的长度。
单次数据产出范围在1.65-7.5Gb
Reads数:7-25 million
应用:在Illumina测序技术准确性的基础上,实现转录组和靶向重测序应用。
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